Aguas de Córdoba manifiesta su voluntad de mejora continua de las condiciones de trabajo, para elevar el nivel de protección de la salud y la seguridad de los trabajadores a través de la Prevención de los Riesgos Laborales (PRL). Dado el desenvolvimiento que tiene la política preventiva en el ámbito de la empresa, el Sistema de Gestión Integral comenzó con la implantación de la norma estándar OHSAS 18001:2007.

En 2020 se ha certificado en la norma ISO 45001:2018, siendo una de las primeras empresas cordobesas en obtener esta certificación.

El sistema de organización de la prevención de Aguas de Córdoba somete su sistema a una Auditoría Legal con carácter bienal.

Los 12 miembros que forman el Comité de Seguridad y Salud de Aguas de Córdoba tienen una implicación directa en la elaboración, puesta en práctica y evaluación de los planes y programas de prevención de riesgos en la empresa.